什么叫较大的matlab程序？不要以为程序很长就叫大。
什么叫感觉要跑不动了？是你感觉到还是计算机？

一般情况下应该不会因为这个问题重起，如果你机子配置较差，在跑程序的时候就不要再做其他事情了，将matlab的进程设置为最高，否则可能会造成它没有响应。

如果你能提供更多的信息，可能会有更好的回答，暂时只能说这么多了。

图像操作是要转存到矩阵的，看看你的图像是不是太大，造成溢出了。如果是一个连续的点阵，建议你每隔一段（比如说10点）画点，这样会快很多。

还有，建议你给这个程序人为地加上一个类似于log的文件，记录每一步，并将它写到这个文件里。这样出问题后，你可以看看在哪里死了。如果几次都是在同一个地方，你就要注意那段程序了。如果是随机的，可能还是你windows的问题吧。