应该看清楚你们签的合同， 和搞清楚哪一个部门付的你减免部分， 然后亲自走一趟， 和那个部门说一下自己情况， 看那个地方怎么说。
lz说， 要去工作后来又没有去的是一个大公司。 我的感觉是， 大公司， 越是特别大的公司， 财务制度越严格， 还有audit， 你还给他钱， 他要入账， 他为你支出的这部分和他从你这里收回的部分不符， 是要给出说明的。 而且， 他收了你的钱， 他应该给你一个收据， 这都要有名头的。
如果真的那个公司弄错了， 你从为你垫付的部门拿到回复， 也更有证据指出他们的失误， 可以理直气壮地去反驳他们， 也根本不必考虑自己的名誉问题， 因为本来就是他们错了， 那还客气什么。